Гистологическое строение промежностной и вышележащей частей прямой кишки весьма различно. Выстилка промежностной части (анального канала), представляющая производное эктодермы, является продолжением кожного покрова, но отличается отсутствием придатков кожи (волос, сальных и потовых желез) и истончением эпидермального покрова с уменьшением числа слоев клеток до 4—5 вместо 15—20. Только в нижней трети анального канала появляются придатки кожи (сальные и потовые железы). Слизистая оболочка кишки содержит большое количество железистых трубок, выстланных цилиндрическим эпителием, который местами имеет вид бокаловидных клеток, переполненных слизью, а также лимфоидные скопления в виде солитарных узелков. Подслизистый слой состоит из рыхлой соединительной ткани, легко растяжимой и весьма богатой кровеносными и лимфатическими сосудами. Мышечный слой, наиболее толстый, состоит из внутренних — циркулярных и наружных-продольных волокон. Серозный покров состоит из однослойной мезотелиальной выстилки и 4—5 тонких слоев эластических волокон, под которыми располагается субсерозная сеть кровеносных и лимфатических сосудов. Серозный покров играет важную роль в процессах всасывания благодаря выявленным на нем мелким ворсинам и плоским аркадам, связанным с субсерозной сосудистой сетью